以实验室内部为集成范围,信息集成的工作主要集中在LIMS与各种分析仪器之间的集成,也就是LIMS的集成。从LIMS的定义来看,仪器数据的自动采集,即仪器连接,是LIMS系统中十分重要的模块,也是用户衡量LIMS实施成功与否的一个重要指标。下面就跟谱标小编一起来详细看看吧~
将仪器连接到LIMS的好处是显而易见的。让仪器进入LIMS的集成后,由分析仪器到LIMS的自动数据传输将代替测试和质量控制结果数据的键盘输入,从而避免了手工模式下的撰抄错误。数据自动传输通常是通过LIMS对数据文件的读取来完成的,数据文件通常存放在LIMS所跟踪扫描的某个目录,它是以特定的格式来组织和传输的,以确保数据能够准确无误地转移到LIMS系统合适的数据表中。
仪器接口的类型
实验室中仪器与LIMS的接口种类繁多,但是从接口的模式来看,大致可分为以下几种:LIMS与仪器工作站的双向传输;LIMS与仪器工作站的单向传输;LIMS与无工作站仪器的单向传输。
基于仪器文件的仪器集成与LIMS的集成的实现
对于可与LIMS连接实现LIMS与仪器工作站的双向传输和单向传输的仪器,LIMS是从存储在本地硬盘或者网络硬盘上的仪器产生的数据文件中提取数据,并把提取到的有用数据映射到LIMS中。该仪器可以没有连接到工作站但是它必需把它的数据输送到一个LIMS可以访问的地方。
仪器获取数据的过程如下:
1)从仪器获取数据到LIMS管理系统应用。把仪器文件存储到指定的目录下,LIMS会定期扫描该文件夹。
2)从仪器数据中提取信息,根据设定的解析脚本,LIMS提取仪器文件数据。
3)使用提取的仪器数据。根据预先定义好的映射脚本,LIMS把提取出来的数据映射到相关样品的结果中。
从仪器数据中提取信息。根据在仪器属性里面定义好的的解析脚本,LIMS提取仪器文件数据里面的相关信息。所谓解析脚本(Parsing Seript)就是一种允许你从仪器文件提取或者解析各种信息的仪器控制脚本,解析脚本可应用于各种格式的仪器数据并可应用于“实时”,例如当数据接收时。可以这样理解解析脚本这个概念:解析脚本就是一系列的导航,指引LIMS如何读取数据文件,即引导LIMS去“忽略”文件中大多数的内容而仅仅“记住”规定的项目。这些导航是由一系列需要设定参数的命令组成。
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